Descomprimimos el core (donkey_59-3.gz o simplemente donkey.gz),  y lo ejecutamos:

$ gunzip donkey_59-3.gz
$ chmod +x donkey_59-3
$./donkey_59-3
Welcome to eDonkey2000 command line client v16.16.59.
Enter commands at any time (type '?' for help)
> Loading shared files...
Done loading shared files.

Debemos creamos un usuario del sistema (en este caso NomUsuari), estableciendo la velocidad máxima tanto de bajada (20 KB/sec) como de subida (7 KB/sec).

> name NomUsuari
ok.
> dumax 20 7
ok.

Luego lo que vamos a hacer es crear un usuario y una contraseña para poder conectar desde los clientes gráficos a nuestro core (o cliente en modo texto).

pass RemoteUser RemotePass

Para ver las opciones definidas hemos de usar el comando vo:

> vo
Name: NomUsuari
AdminName: RemoteUser
AdminPass: RemotePass
AdminPort: 4663
Max Download Speed: 20.00
Max Upload Speed: 7.00
Line Speed Down: 0.00
Door Port: 4662
AutoConnect: 0
Verbose: 0
SaveCorrupted: 1
AutoServerRemove: 1
MaxConnections: 100

Una vez correctamente configurado el Command line client, salimos guardando la configuración introducida.

> q
Are you sure wanna quit (Y/n)?
y

Ahora lo que hacemos es volver a lanzar el mismo programa pero indicandole que espere conexiones del cliente gráfico, para lo que le añadimos un guión al ejecutarlo:
$ ./donkey_59-3 -

Despues lo que haremos es lanzar el cliente gráfico que abrira el Edonkey2000 en nuestra máquina:

./linux_gui_alpha_unstable

A partir de este momento, el funcionamiento de Edonkey2000 para linux es totalmente similar a otros programas de Compartición de ficheros (P2P), tales como el Napster, Gnutella, etc ...
Básicamente realizaremos conexiones con multiples servidores, una vez establecidas las conexiones, haremos las búsquedas que nos permitiran ir bajando los ficheros que nos interesen y que otra gente tenga a bien compartir con nosotros.